Buenas Ángel,
Esto también ocurre en los motores sin ser MHEV si tienes el start stop activado. En mi caso le instalé un módulo para que cada vez que arranque el coche, automáticamente se desconecte, dejándome a mí elección cuando quiero que actúe. De las mejores cosas que le he puesto.
Si en los nuevos modelos no se puede quitar, yo te diría que antes de tomar la salida bajes el ritmo y lleves el coche algo revolucionado sin carga de acelerador, para que circule la mayor cantidad de aceite y refrigerante por el motor. Con eso debería ser suficiente, a no ser que vayas de circuito por la vida, y ahí sí debas circular unos cuantos km a un ritmo menor para enfriar el turbo.
Un saludo.