Tengo exactamente el mismo problema que tu.
El coche es tambien un A4 1.9 tdi Avant de 2004 con 145000 kms.
Lleva asi 6 meses, con el Vag-com no pueden entrar a la centralita del cambio, lo he llevado a Audi y me han cambiado el aceite de la caja de cambios y el filtro, pero no han conseguido nada. (Bueno si, dinero suficiente para pagarle la mitad del sueldo al gerente ).
Ahora me dicen que lo lleve otra vez, pq el protocolo de audi dice que tienen que ir regulando unas mariposas de no se que para ver si asi se soluciona.
Ya me veo otra semana sin coche mientras "aprenden" a reparar un multitronic con cargo a mi cuenta, para que dentro de un par de meses, me digan que lo sienten, pero que toca cambiar la caja completa por 6000 eurillos de nada.
Espero que tengas suerte. Si consigues una solución barata me apunto.