Hola.
A mi me paso algo muy similar con los amortiguadores delanteros.
Simplemente era que me los habian montado mal (En concesionario oficial Audi) y los amortiguadores delanteros no los habian montado adecuadamente en la unión con la mangueta delantera.
Apenas deberias notar diferencia de altura aunque los amortiguadores fueran nuevos, pues como bien sabeis la altura la dan los muelles.
(Comprueba realmente que los amortiguadores son especificos para este modelo y que no hayas montado otros de vastago más largo ó algo por el estilo)
Un saludo.