Buenas, simplemente el dataset que llevan tus centralitas de puertas no es el adecuado para tu coche, no era necesario invertir la polaridad del motor, el meter el dataset bueno solucionará tus problemas.
Puedes usar la herramienta VCtool y descargarte el dataset (pagando) original para tu coche (aunque la centralita es diferente, el dataset es el mismo).
También puedes usar odis u otros, pero tú problema es el dataset