Por lo que dices, lo que oyes son las trampillas del clima abriendo y cerrando, si te funciona bien no te preocupes. Prueba a darle a los botones para que heche el aire por arriba, por en medio y por los pies(primero una, luego la otra...) y veras que hace el mismo ruido, si le das a la recirculacion supongo que tambien si es ese el ruido que oyes no te preocupes.
Saludos