A ver Yo en mi A4 B6 tambien pase de faro Halogeno a Xenon, pero no he perdido la regulacion interior de los faros, lo sigo regulando desde el boton de dentro coma antes hacia con los halogenos.
La instalacion para mi que fue cambiar de faro completo fuen totalmete PLUG AND PLAY ni codificacione ni historias raras, ni por supuesto fallos en el cuadro(erros ABS, Frenos etc).
En la seccion de documentos de este foro explico como hice para no perder la regulacion interior, lo que no se es si esto valdra para tu coche, desde luego para un A4 B6 con faro Valeo si vale lo yo hice.
Saludos y suerte espero todo se te arregle bien.