A veces se pueden quedan diferentes particulas (arenilla, polvo, óxido que queda después de la lluvia, etc) entre los discos y las pastillas. Si ves que pegando un frenazo un poco fuerte desaparece entonces no te preocupes, se trata de eso.
Si por el contrario no desapareciera y te lo hiciera de continuo y cada vez que pisas el freno, revisa las pastillas porque puede ser que se hayan gastado y esté tocando la parte de hierro con los discos y esto ya sería algo mas serio. Pero por lo que dices, no creo que sea tu caso.