Si la EGR se quedara abierta perderías potencia y además el ruido, creo yo, que no es de adelantado como describren. El ruido cuando el motor aspira humo es un ruido blando, sordo, ... cuando la cierras del todo el sonido del motor se vuelve nítido.
Por la aleatoriedad de cuando ocurre y cuando no se me antoja un fallo eléctrico, por eso intuyo el fallo del inyector inteligante. En realidad es un sensor que utiliza la centralita para corregir el avance de la inyección. Si la inyección de adelantara el sensor lo detectaría y de no ser capaz de corregirla indicaría fallo. Otra cosa es que el sensor esté dando información incorrecta y se avance tanto la inyección que suene a "barreiros". Otra posibilidad es el sensor de temperatura del combustible, que también influye en en avance de inyección.
Indispensable el Vagcom y revisar los fallos registrados, el "Timing", la temp. del combustible,...